Есть несколько вопросов по ПЛ КБФ.
Не уверен в составе 3-й учебной бригады, кроме того в составе дивизиона вновь строящихся и капитально ремонтирующихся ПЛ (если он конечно был)

1-я бригада подводных лодок
Командир-  капитан 1-го ранга Египко Николай Павлович 22.06—01.09 1941
Начальник штаба - капитан 2-го ранга  Курников Лев Андреевич
Заместитель по политической части -  полковой комиссар Обушенков Г.М.


База: (управление-г. Рига)

Состав:
1-й дивизион подводных лодок    (Усть-Двинск)                                                                                         
Командир капитан 3-го ранга Трипольский Александр Владимирович

С-1(22 июня 1941г. встретила в Либаве, на заводе "Тосмаре" в среднем ремонте (окончание работ по плану - 15.06) 23 июня 1941 г.  взорвана личным составом из-за невозможности дать ход и уйти из Либавы.)
Командир -  капитан-лейтенант Морской Иван Тихонович (погиб 24.06.41 г. на ПЛ С-3)
С-3 (22 июня 1941 года  встретила в капремонте в доке завода "Тосмаре" в Либаве. 24 июня 1941 г. в районе маяка Ужава потоплена германскими торпедными катерами "S-60" и "S-35" из состава 3-ей катерной флотилии.)
Командир -  капитан-лейтенант Костромичев Николай Александрович (погиб 24.06.41 г. вместе с лодкой)
С-4 (22 июня 1941г. встретила в Устъ-Двинске. В январе 1945 г. не вернулась из похода)
Командир – капитан-лейтенант Абросимов Дмитрий Сергеевич (15 августа 1942 г. погиб во время подрыва лодки на мине при переходе из Кронштадта в Ленинград)
С-5 (22 июня 1941г. встретила в Устъ-Двинске. 28 августа 1941 г. погибла на мине)
Командир -  капитан 3-го ранга Бащенко Александр Аркадьевич
С-6 (22 июня 1941г. встретила в Устъ-Двинске. В августе 1941 г. не вернулась из похода)
Командир -  капитан-лейтенант Кульбакин Василий Федорович
С-7 (С 19 июня 1941 г. находилась в дозоре на западных подходах к Ирбенскому проливу. 21 октября 1942 г. потоплена финской ПЛ "Vesihiisi")
Командир – капитан-лейтенант Лисин Сергей Прокофьевич  (пленен 21.10.42 г.)
С-8 (22 июня 1941г. встретила в Устъ-Двинске. В октябре 1941 г. не вернулась из похода)
Командир - капитана 3 ранга Бойко Михаил Семенович
С-9 (22 июня 1941г. встретила в Либаве, где должна была пройти доковый ремонт. В августе 1943 г. не вернулась из похода)
Командир – капитан-лейтенант Рогачевский Сергей Анатольевич (7 ноября 1941 г. погиб во время шторма в Аландском море)

2-й дивизион подводных лодок                                                                                             
Командир- капитан 3-го ранга Червинский Владимир Александрович

С-10 (22 июня 1941г. встретила в Устъ-Двинске. 28 июня 1941 г. погибла между Пиллау и Либавой)
Командир -  капитан 3-го ранга Бакунин Борис Константинович (погиб 28.06.41 г. вместе с лодкой)
С-101 (22 июня 1941г. встретила в Устъ-Двинске.)
Командир – капитан 3-го ранга Векке Игорь Кузьмич
С-102 (22 июня 1941г. встретила в Устъ-Двинске.)
Командир - капитан-лейтенант Иванов Борис Владимирович
3-й дивизион подводных лодок   (Либава)                                                                                         
Командир - капитан 3-го ранга Аверочкин Анатолий Кузьмич ( погиб 28.08.1941 г. на ПЛ  С-5)
Л-3 (22 июня 1941г. встретила в Либаве)
Командир – капитан 3-го ранга Грищенко Петр Денисович
«Калев» (22 июня 1941г. встретила в Либаве в организационном периоде. В ноябре 1941г. не вернулась из похода)
Командир – старший лейтенант Ныров Борис Алексеевич
«Лембит» (22 июня 1941г. встретила в Либаве в организационном периоде.)
Командир – капитан-лейтенант Полещук Владимир Анатольевич
«Спидола» (22 июня 1941г. встретила на заводе "Тосмаре" в Либаве в среднем ремонте (отсутствовали аккумуляторы). 23 июня 1941 г. взорвана личным составом из-за невозможности дать ход и уйти из Либавы.)
Командир -  старший лейтенант Бойцов В.И.
«Ронис» (22 июня 1941г. встретила на заводе "Тосмаре" в Либаве в среднем ремонте. 23 июня 1941 г. взорвана личным составом из-за невозможности дать ход и уйти из Либавы.)
Командир -  капитан-лейтенант Мадиссон Александр Иванович (23 февраля 1944 г. покончил жизнь самоубийством)

4-й дивизион подводных лодок ( Лиепая)                                                                                           
Командир - капитан-лейтенант Матвеев Степан Ионович ( погиб 23.06.1941 г. на ПЛ  М-78)

М-71 (22 июня 1941г. встретила на капитальном ремонте в заводе Тосмаре в Либаве. 24 июня 1941 г.  взорвана личным составом из-за невозможности дать ход и уйти из Либавы.)
Командир капитан-лейтенант Костылев Лев Николаевич
М-77 (22 июня 1941г. встретила в Либаве)
Командир старший лейтенант Хлюпин Николай Алексеевич
М-78 (В начале июня 1941 г. несла дозор в устье Ирбенского пролива. 22 июня 1941г. встретила в Либаве. 23.06.1941 г. погибла в результате атаки германской подводной лодки "U-144")
Командир старший лейтенант Шевченко Дмитрий Леонтьевич
М-79 (22 июня 1941г. встретила в Либаве)
Командир старший лейтенант Автомонов Иван Васильевич
М-80 (22 июня 1941г. встретила в Либаве на капитальном ремонте в заводе Тосмаре. 24 июня 1941 г.  взорвана личным составом из-за невозможности дать ход и уйти из Либавы.)
Командир капитан-лейтенант Мочалов Федор Александрович (в июне 1941 г. попал в плен в Либаве)
М-81(22 июня 1941г. встретила в Либаве.1 июля 1941 г.  у о.Вормси подорвалась на мине и погибла.)
Командир капитан-лейтенант Зубков  Федор Антонович
М-83 (22 июня 1941г. встретила в Либаве. 25 июня 1941 г.  взорвана личным составом из-за невозможности уйти из Либавы.)
командир старший лейтенант Шалаев Павел Михайлович

Эскадренный миноносец «Энгельс» (22 июня 1941 году в составе 1-ой бригады подводных лодок в Таллине. Вскоре был возвращён в состав 3-го дивизиона эсминцев КБФ.24 августа 1941 года в 17.05 подорвался на мине, которая полностью разрушила корму, через полчаса подорвался на второй мине, после чего сдетонировал боезапас во втором погребе. В 17 часов 50 минут эсминец затонул.)
Командир - капитан-лейтенант Васильев В.П.

Плавбаза «Иртыш» (Плавбаза 2-го дивизиона 1-й бригады)
Командир –

Плавбаза «Смольный» (Плавбаза 1-го дивизиона 1-й бригады)
Командир -



2-я бригада подводных лодок
Командир-  капитан 2-го ранга Орел Александр Евстафьевич
Начальник штаба - капитан 1-го ранга Ивановский Н.С.
Заместитель по политической части - полковой комиссар  Бобков Б.Н.

База: Таллин - Кабатажная гавань

Состав:
6-й дивизион подводных лодок (Таллин)                                                                                               
Командир- капитан 2-го ранга Федотов Михаил Васильевич

Щ-309 (В ночь на 22.6 возвращалась в Таллин с учений в Рижском заливе (прибыла на внешний рейд Таллина около 5 ч 22.6))
Командир - капитан-лейтенант Кабо Исаак Самойлович
Щ-310 (3-11 июня 1941 г. несла дозор в устье Финского залива. В ночь на 22.6 возвращалась в Таллин с учений в Рижском заливе)
Командир - капитан-лейтенант Ярошевич Дмитрий Клементьевич
Щ-311 (3-11 июня 1941 г. несла дозор в устье Финского залива. В ночь на 22.6 возвращалась в Таллин с учений в Рижском заливе.  В октябре 1942 г. не вернулась из похода.)
Командир - капитан-лейтенант Сидоренко Петр Антонович

7-й дивизион подводных лодок                                                                                            
Командир- капитан 2-го ранга  Егоров Владимир Алексеевич

Щ-317 (22 июня 1941г. встретила в Таллине в среднем ремонте. В июле 1942 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан 3-го ранга Андронов Алексей Герасимович
Щ-318 (22 июня 1941г. встретила в Таллине в среднем ремонте.)
Командир - капитан-лейтенант Афанасьев Владимир Константинович
Щ-319 (22 июня 1941г. встретила в Таллине в среднем ремонте. В сентябре 1941 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Агашин Николай Сидорович
Щ-320 (22 июня 1941г. встретила в Таллине в среднем ремонте. В октябре 1942 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Вишневский Иван Макарович
Щ-322 (22 июня 1941г. встретила в бухте Локса в организационном периоде. В октябре 1941 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Ермилов Виктор Андреевич
Щ-323 (22 июня 1941г. встретила в бухте Локса в организационном периоде. 1 мая 1943 г. при переходе из Ленинграда в Кронштадт подорвалась на донной неконтактной мине и сразу же затонула.)
Командир – капитан-лейтенант Иванцов Федор Иванович
Щ-324 (22 июня 1941г. встретила в бухте Локса в организационном периоде. В ноябре 1941 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Тархнишвили Георгий Иорамович

8-й дивизион подводных лодок   (ВМБ Ханко)                                                                                         
Командир - капитан 3-го ранга Юнаков Евгений Гаврилович

М-90 (22 июня 1941г. встретила в Таллине (по другим данным в Ханко))
Командир – старший лейтенант Татаринов Иван Михайлович
М-94 (22 июня 1941г. встретила в Таллине 22.07.1941 г. погибла в результате атаки германской подводной лодки "U-140")
Командир - старший лейтенант Дьяков Николай Васильевич
М-95 (22 июня 1941г. встретила в Ханко В июле 1941 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Федоров Леонид Петрович
М-96 (22 июня 1941г. встретила в Ханко 8 сентября 1944 г. погибла в Нарвском заливе, предположительно от подрыва на мине.)
Командир - капитан-лейтенант Маринеско Александр Иванович
М-97 (22 июня 1941г. встретила в текущем ремонте в Таллине 3 сентября 1942 г. погибла в районе о.Гогланд предположительно от подрыва на мине.)
Командир - капитан-лейтенант Мыльников Александр Иванович
М-98 (22 июня 1941г. встретила в Ханко 14 ноября 1941 г. погибла в районе о.Кери предположительно от подрыва на мине.)
Командир - капитан-лейтенант Буззубиков Иван Иванович
М-99 (22 июня 1941г. встретила в Ханко 27 июня 1941 г. потоплена южнее о. Утё германской подводной лодкой "U-149".)
Командир - старший лейтенант Попов Борис Михайлович
М-102 (22 июня 1941г. встретила в текущем ремонте в Таллине)
Командир - старший лейтенант Гладилин Петр Васильевич (7 июля 1943 г. погиб при бомбежке о. Лавенсаари)
М-103 (22 июня 1941г. встретила в Ханко 25-28 августа 1941 г. погибла в устье Финского залива предположительно от подрыва на мине.)
Командир - капитан-лейтенант Нечкин Вадим Дмитриевич

Плавбаза «Ока»
Командир –

Плавбаза «Полярная Звезда»
Командир -

Плавбаза «Амур» (В 1938 году переоборудован в плавбазу и передан начальнику военно-морских учебных заведений. С 20 мая 1941 года плавбаза 2-й бригады подводных лодок КБФ. Получил повреждения в результате налета германской авиации, и 28 августа 1941 года затоплен в Таллине для заграждения входа в гавань.)
Командир -

3-я (учебная) бригада подводных лодок
Командир -  контр-адмирал  Заостровцев Алексей Тимофеевич
Начальник штаба - капитан 2 ранга  В.А.Касатонов
Заместитель по политической части

9-й дивизион подводных лодок                                                                                          
Командир - капитан-лейтенант Мохов Николай Константинович

М-72 (22 июня 1941г. встретила на капитальном ремонте на Морском заводе в Кронштадте (план вводв в строй - 1942 год), в августе ремонт прекратили и подлодку законсервировали, личный состав обращен на формирование частей морской пехоты.)
Командир -
М-73 (22 июня 1941г. встретила на капитальном ремонте на Морском заводе в Кронштадте (план ввода в строй - 1942 год), в августе ремонт прекратили и подлодку законсервировали, личный состав обращен на формирование частей морской пехоты.)
Командир -
М-74 (22 июня 1941г. встретила на капитальном ремонте на Морском заводе в Кронштадте (план ввода в строй - 1942 год), в августе ремонт прекратили и подлодку законсервировали, личный состав обращен на формирование частей морской пехоты. 23 сентября 1941 г.потоплена авиацией противника.)
Командир -
М-75  (22 июня 1941г. встретила в ремонте в Кронштадте(план ввода в строй - 1942 год), в августе ремонт прекратили и подлодку законсервировали.)
Командир -
М-76 (22 июня 1941г. встретила в ремонте в Кронштадте(план ввода в строй - 1942 год), в августе ремонт прекратили и подлодку законсервировали.)
Командир -

13-й дивизион подводных лодок                                                                                         
Командир-

С-11 (22 июня 1941г. встретила в Кронштадте, где проходила швартованные испытания (степень технической готовности - 98%), 2 августа 1941 г. погибла в устье пролива Соэлавяйн на минном заграждении "Кобург")
Командир - капитан-лейтенант Середа Анатолий Михайлович (погиб 2.08.41 г. на лодке)
С-12 (22 июня 1941г. встретила в Ленинграде - готовилась к ходовым испытаниям (степень технической готовности - 90%). В августе 1943 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Тураев Василий Андрианович
К-51 (22июня 1941г. встретила в достройке (степень технической готовности составляла на 1 июля 1941 года 88,2 )
Командир - капитан-лейтенант Лепешкин Алексей Васильевич

14-й дивизион подводных лодок                                                                                           
Командир-капитан 3-го ранга Тузов Иван Николаевич (погиб 2.08.41 г. на ПЛ С-11)

Щ-303 (22июня 1941г. встретила в стадии окончания капитального ремонта (степень готовности - 90%) в г. Кронштадт)
Командир - капитан-лейтенант Травкин Иван Васильевич
Щ-304 (22июня 1941г. встретила в стадии окончания капитального ремонта (степень готовности – 92,6 в г. Кронштадт. В декабре 1942 г. не вернулась из похода.)
Командир - капитан-лейтенант Афанасьев Яков Павлович
К-3 (17 сентября 1941 г. вошла в состав Северного флота, 21 марта 1943 г. потоплена в районе м. Нордкап кораблями ПЛО "Uj-1102", "Uj-1106", "Uj-1111".)
Командир - капитан-лейтенант Малафеев Кузьма Иванович
К-21 (22июня 1941г. встретила на переходе с Балтики на Север по Беломорканалу.)
Командир - капитан-лейтенант Жуков Аркадий Алексеевич
К-22 (22 июня 1941 года встретила в Ораниенбауме, готовясь к переходу на Северный флот. 17 сентября 1941 г. официально вошла в состав Северного флота, 19 февраля 1943г. погибла между Вардё и м. Нордкин предположительно на мине)
Командир - капитан 3-го ранга  Котельников Виктор Николаевич
К-23 (22июня 1941г. встретила на переходе с Балтики на Север по Беломорканалу на пути из Повенца в Беломорск., 17 сентября 1941 г. официально вошла в состав Северного флота. 12 мая 1942 г. погибла в Оксфьорде предположительно в артиллерийском бою с кораблями ПЛО "Uj-1101", "Uj-1109", "Uj-1110")
Командир - капитан 3-го ранга  Потапов Леонид Степанович
Л-1 (22 июня 1941 года встретила у стенки Адмиралтейского завода № 196 в Ленинграде в ремонте (степень технической готовности на 01.07.41 - 64%). В августе ремонт прекратили и подлодку законсервировали личный состав обращен на формирование частей морской пехоты. 8 ноября 1941 г. от попаданий артиллерийских снарядов затонула на Неве.)
Командир - капитан 3-го ранга Могилевский  Сергей Сергеевич
Л-2 (22 июня 1941 года встретила в Ленинграде в ремонте. 14 ноября 1941 г. погибла в районе о. Кери на минах заграждения "D.46")
Командир - капитан-лейтенант Чебанов Александр Петрович
Л-20 (22 июня 1941 года встретила в Ленинграде у заводской стенки в стадии достройки. В сентябре переведена по Беломорканалу в Молотовск на завод № 402, 28.08.42 г. вошла в состав Северного флота.)
Командир - капитан 3-го ранга Тамман Виктор Федорович
Л-21 (22 июня 1941 года встретила в Ленинграде у заводской стенки в стадии достройки (Степень технической готовности корабля на 1 июля 1941 года составляла 74%.))
Командир - капитан-лейтенант Куликов Николай Николаевич (14 августа 1941 г. погиб в боях у г. Копорье в составе морской пехоты)
Л-22  (22 июня 1941 года встретила в Ленинграде у заводской стенки в стадии достройки. В сентябре 1941 г. переведена по Беломорканалу в Молотовск на завод № 402, 28.08.42 г. вошла в состав Северного флота.)
Командир - капитан-лейтенант Бютнер Георгий Николаевич

Отдельный учебный дивизион подводных лодок  Учебного Краснознаменного отряда подплава. им. С.М.Кирова                                                       
Командир- капитан 2-го ранга Эйхбаум Н.Э.
Формирование:  На лодках этого дивизиона проходили практическое обучение краснофлотцы, старшины команд и командиры отделений, а также средний комсостав –командиры боевых частей, прошедшие теоретическую подготовку в Учебном Отряде Подводного Плавания им. С.М.Кирова (УОПП) или на Специальных Курсах Усовершенствования Командного Состава (СКУКС). 13.01 1935 отряду было присвоено имя С. М. Кирова, а 10.07 1939 вручен орден Красного Знамени. С 1939 в его состав вошли Специальные курсы командного состава и дивизион подводных лодок.

База:  Ораниенбаум

П-1 (22 июня 1941 г. встретила в Ораниенбауме, где находилась в организационном периоде. В сентябре 1941 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Логинов Иван Андреевич (погиб в сентябре 1941 г. вместе с лодкой)
П-2 (22 июня 1941 г. встретила в Ораниенбауме, где находилась в организационном периоде.)
Командир - капитан-лейтенант Попов Иван Петрович
П-3 (22 июня 1941 г. встретила в Ораниенбауме, где находилась в организационном периоде.)
Командир - капитан-лейтенант Пантелеев Алексей Николаевич
Щ-301 (22 июня 1941 г. встретила в Ораниенбауме, где находилась в организационном периоде. 28 августа 1941 г. погибла на меридиане м. Юминда на мине заграждения «F-22», выставленном финскими минзагами «Риилахти» и «Руотсинсальми»)
Командир - капитан-лейтенант Грачёв Иван Васильевич
Щ-302 (22 июня 1941 г. встретила в Кронштадте в капитальном ремонте. 14 октября 1942 г. была потоплена к северо-западу от о. Суур-Пакли предположительно финским самолётом SB-10)
Командир - капитан-лейтенант Драгенов Петр Никитич
Щ-305 (22 июня 1941 г. встретила в Ораниенбауме. 31 октября 1942 г. таранена финской ПЛ «Vetechinen», в результате чего затонула)
Командир - старший лейтенант Кочетков Константин Сергеевич (к этому моменту исполняющий обязанности командира Середа Анатолий Михайлович, уже получивший назначение на «С-11» еще не успел сдать дела. Он же вел корабль в первом боевом походе)
Щ-306 (22 июня 1941 г. встретила в Ораниенбауме. В ноябре 1942 г. не вернулась из похода)
Командир - старший лейтенант Смоляр Николай Иванович
Щ-307 (22 июня 1941 г. встретила в Ораниенбауме)
Командир – капитан-лейтенант Петров Николай Иванович
Щ-308 (22 июня 1941 г. встретила в Ораниенбауме. 27 октября 1942 г. потоплена в районе о. Утэ финской ПЛ «Ику Турсо» )
Командир - капитан-лейтенант Маркелов Александр Филиппович
Щ-411 (25 июня 1941 г. Постройка прекращена, а лодка законсервирована. 24 апреля 1942 г. потоплена немецкой артиллерией в Неве)
Командир -
Б-2
Командир - капитан-лейтенант Быховский Израиль Адольфович
L-55
Командир - старший лейтенант Браун Илья Яковлевич
Р-1
Командир - капитан-лейтенант Карташев Николай Иванович

[b]Отдельный дивизион строящихся и капитально ремонтирующихся подводных лодок [b]                                                                                                                                                           
Командир-
Д-2 (22 июня 1941г. встретила в капитальном ремонте на слипе завода № 189 в Ленинграде. Степень технической готовности корабля составляла 95,8%. Числилась в составе СФ)
Командир - капитан-лейтенант Линденберг Роман Владимирович
Щ-405(22 июня 1941 г. встретила в Кронштадте, где завершала программу испытаний (степень технической готовности - 98. В июне 1942 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Сидоренко Илья Александрович (погиб в августе 1941 г.)
Щ-406(22 июня 1941 г. встретила в Кронштадте, где завершала программу испытаний (степень технической готовности - 98. В мае 1943 г. не вернулась из похода)
Командир - капитан-лейтенант Максимов Владимир Васильевич
Щ-407(22 июня 1941 г. встретила в Кронштадте, где завершались монтажные работы (степень технической готовности – 85,6.)
Командир – капитан-лейтенант Морозов Павел Александрович
Щ-408(22 июня 1941 г. встретила в Кронштадте, где завершались монтажные работы (степень технической готовности – 82,7.. В мае 1943 г. не вернулась из похода)
Командир – капитан-лейтенант Кузьмин Павел Семёнович
Щ-412 (25 июня 1941 г. Постройка прекращена, а лодка законсервирована.)
Командир -
Щ-413 (10 июля 1941 г. Постройка прекращена, а лодка законсервирована. Заводской №552.)
Командир -
Щ-414 (10 июля 1941 г. Постройка прекращена, а лодка законсервирована. Заводской №553)
Командир -
К-52 (22 июня 1941 г. встретила в достройке (степень технической готовности корабля составляла на 1 июля 1941 года 89,1%.))
Командир - капитан-лейтенант Шулаков Евгений Георгиевич
К-53 (22 июня 1941 г. встретила в достройке (степень технической готовности корабля составляла на 1 июля 1941 года 80,6%.))
Командир –
К-54 (22 июня 1941 г. встретила в достройке)
Командир –
К-55 (22 июня 1941 г. встретила в достройке (степень технической готовности корабля составляла на 1 июля 1941 года 61,4%.))
Командир –
К-56 (22 июня 1941 г. встретила в достройке (степень технической готовности корабля составляла на 1 июля 1941 года 86,8%.))
Командир – капитан 3-го ранга Гольдберг Григорий Алексеевич